食品検査センター
微生物DNA同定検査
検査の流れ
ご依頼の前に、検査業務規約をご確認ください。
- STEP1
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キノコ、シャーレ上のコロニー 等
直接DNA解析
- 培養済みコロニー
- 単一試料(キノコ等)
- STEP2
-
DNA解析
- 試料からのDNA抽出
- 解析部位をPCRにより増幅
- 塩基配列の解読
- 相同性検索
使用データベース
- 自社データベース
- DDBJ/EMBL/GenBankが提供するデータベース
解析部位
- 細菌16S rRNA遺伝子のV3/V4領域
- 真菌18S rRNAと5.8SrRNA間のスペーサー領域(ITS1)
- 試料からのDNA抽出
- STEP3
-
検査結果のご報告
検査結果の報告書は以下のような内容になっております。
ご報告内容
- 検体の写真
- 顕微鏡写真(撮影が困難なものは無し)
- 所見(弊社に情報がある場合のみ)
- 近縁上位5種と同一性(%)
弊社で情報を保有している微生物に該当した場合、
その菌の特徴についての所見もご報告いたします。(一例)
同定結果
試料はクラドスポリウム・クラドスポリオイデス(Cladosporium cladosporioides)であると同定した。
所見
本菌は自然での分布が広い菌種であり、世界各地に分布する。好湿性で、クロカビやクロカワカビといった俗名がある。
引用:高鳥浩介、『かび検査マニュアルカラー図鑑』、テクノシステム、2002
検体写真
顕微鏡写真(1目盛=1mm)